Родился в станице Упорной в 1905 году. Призывался в РККА в 1941 году Упорненским РВК. По сведениям жены, Левченко Агрепины Петровны, связь с семьей прервалась с 22 марта 1942 года. Признан пропавшим без вести с апреля 1943 г. Имя Василия Афанасьевича Левченко внесено в 3 том Книги Памяти Краснодарского края.