Родился в станице Упорной 12 января 1908 года. Проживал в Упорной на ул. Краснопутиловская, д. 16. В 1941 году был призван в ряды РККА Упорненским РВК. Служил в рядах 557-го стрелкового полка 153-й стрелковой дивизии, во время боев в Верхнедонском районе Ростовской области в середине июля 1942 года пропал без вести. Со слов жены, Нефедовой Марии Павловны, связь с семьей была прервана в июле 1942 года. По документу о военнопленных Нефедов М.Д. попал в плен 15 июля 1942 года и был отправлен в лагерь в г. Кременчуг, где заключенных использовали на тяжелых работах по строительству моста через Днепр. В 1943 г. увезен в Германию, округ Саксония, где помещен в лагерь для военнопленных: сначала в шталаг IV F ( Хартманнсдорф при Хемнице), где работал в рабочих командах на участках Шмёльн, Тойхерн, Хартхау. 23 июня 1944 г. попал в лазарет для военнопленных в г. Хоэнштайн-Эрнстталь, 30.06.1944 г. переведен шталаг IV B (Мюхльберг на Эльбе), где 22 июля 1944 г. умер в лагере Цайтхайн. В карточке военнопленного Нефедова указано, что похоронен он на кладбище Цайтхайн III, блок 1, ряд 18. Имя Михаила Дмитриевича Нефедова внесено в 17-й том Книги Памяти Краснодарского края.